宜博 / lemonboss

- Updated `GET /api/agent/:agentId/info` to include heartbeat and cron configurations.
- Added `PUT /api/agent/:agentId/heartbeat` to update config.json and toggle service heartbeat on the fly.
- Added `PUT /api/agent/:agentId/cron` to update cron.json list.
- Updated AgentChat.vue detail panel UI to include interactive heartbeat toggles and a cron job management list.

- Updated `POST /api/company/create` to create an empty shell without bootstrapping CXO/HR automatically.
- Updated `master/agent.md` instructions so Master Agent handles all Template library hirings.
- Renamed 'MasterBot' navigation link to 'System Agents'.
- Updated AgentChat sidebar to only show System Agents when accessed via the System Agents link.

Copy innovator pipeline agents from templates/ to system/agents/:
- agent-creator: scaffolds new agents
- innovator: orchestrates FDE training pipeline
- hunter: knowledge hunting (L3-Hunt)
- digester: knowledge digestion (L2-Digest)
- evolver: skill evolution (Evolving)

All 6 system agents now visible in MasterBot agent list.

- CompanyDashboard Goals Tab: upgraded from flat list to full OKR tree view
  with progress bars, node hierarchy, status animations, owner/priority badges
- ClaudeCliProtocol: added --effort flag support (low=disable thinking)
- agent-chat.js: per-agent effort config from config.json cli.effort
- .gitignore: exclude data/companies/, apiconversation/, agent memory/tasks
- New views: TemplateAgents, JobsPanel, PipelineEditor, SkillsMarket
- docs/architecture-v5.md: added decision #13 (thinking control)

1. 根治所有模板 Agent残留的过往公司(LemonV)私人记忆，使其诞生即为全新白纸状态。
2. 提取出统一的 `methodology.md` 基类 Prompt，通过 `agent-chat.js` 强力注入。
3. 从 Master 到各路 Agent 都将强制遵循【从大脑到小脑】的不硬编码理念。
4. 全面引入统一的基础方法论（Harness）：学习(Research) -> 规划(Planning) -> 执行(Execute) -> 验证(Verify)

- 移除了 master/agent.md 中关于自动部署 CEO/CTO/COO/HR 的错误硬编码约定
- 更新了 master/tools.md 工作流，明确 Master 第一步需手动 hire CEO 并派发战略指令
- 清理了 templates/ceo 下自带的、绑定具体公司的 plan.md 和 todo.md 假数据模板，确保 CEO 诞生时是一张白纸

- ClaudeCliProtocol: stderr 检测 rate_limit/429/401 等致命错误时自动 reject sendPrompt Promise
- agent-chat.js: 监听 stderr/disconnected 事件并通过 SSE 推送到前端
- AgentChat.vue: error 事件停止 thinking 状态 + ACP 日志面板显示错误

- System agents: 只保留 master (data/system/agents/master)
- Templates: 所有可复用 agent 模板 (data/system/templates/)
- Companies: 公司创建时自动部署 5 个元 Agent (innovator/hunter/digester/evolver/agent-creator)

路径修复:
- agent-chat.js: /list 扫描路径修正 (system/agents + companies/*/agents)
- agent-manager.js: 动态 agent 查找路径修正
- skill-config-loader.js: 修正 agents root
- pipeline-service.js: pipelines 输出到 companies/{id}/pipelines/
- billing.log: 移至 companies/{id}/logs/ 下

Skills 标准化:
- 所有 template agent 建立 .claude/skills/main_skill/SKILL.md
- company-service._copyTemplate() 新增 .claude/ 目录复制
- innovator SKILL.md v3.0: 移除旧 l3-hunt/l2-digest 命名
- 清理重复 agent_creator, 统一为 agent-creator

清理:
- 移除 data/agents, data/workspace, data/logs, data/goals 旧目录
- 清除所有未使用的 DATA_DIR 声明
- 清除 template 中的 conversations/logs/memory 运行态数据

scripts/demo-harness-company.js creates a company, hires a Base Agent
worker, and simulates the full RPEV lifecycle with real API calls:
- Company creation (skipBootstrap)
- Agent hiring with base template
- meta-research initial skill mount
- 3 transition API calls (plan → execute → verify)
- Hot Swap verification at each stage
- Artifact production validation

- Add task transition CLI and API for Context Flush & Hot Swap
- Enforce strict bash-only tool policy for Base Agents
- Inject  into system prompt for self-retrying loop
- Implement Goal node updates on transitions
- Add P0 Execute pre-approval block (Human-in-the-loop)
- Track token metrics to billing.log

核心改动:
1. agent-chat.js buildSystemPrompt 新增 Layer 0: 为公司Agent自动注入
   公司环境上下文(companyId、roleName、公司共享工作区路径)
   明确禁止写入全局 workspace/ 或 data/workspace/
2. CEO 模板更新: workspace/ 引用改为"公司共享工作区"
3. 清理旧的 workspace/ 和 data/workspace/ 下的废弃公司目录

这些目录是Agent执行任务时误写到全局agents目录下的,
公司Agent的正确路径应为 data/<companyId>/agents/<role>/

核心改动:
1. agent.md: 公司创建流程从5步手动操作改为1条命令自动完成
2. agent.md: 新增自主决策规则 — 用户不给ID时自己起名立刻执行，禁止追问
3. agent.md: 管辖实体从 agent-creator 更新为各公司 HR
4. agent.md: 新增完整的 Bootstrap 自动流水线图示
5. tools.md: 新增 company templates / company fire CLI 文档
6. tools.md: company create 标注为自动Bootstrap

Phase A - Company Bootstrap 自举:
- 新增 _company_bootstrap/manifest.json 模板
- company create 时自动部署 CEO/CTO/COO/HR 四名核心骨干
- 自动启动公司 + 2s后向CEO dispatch战略启动令
- 支持 skipBootstrap 参数跳过自举

Phase B - HR 大一统 (招留管退):
- 新增 hr 模板（agent_creator 的进化体）
- HR 具备完整生命周期管理：招聘/技能装配/监控/辞退
- HR 具备模板发现能力（lemon company templates 查看可用模板如 scrapling_crawler）
- CTO 模板重写：不再亲自 hire，全部通过 task dispatch 向 HR 下发招聘需求单
- CEO 模板更新：确认 Bootstrap 已部署骨干，委派时强调 CTO→HR 招聘链
- 新增 POST /company/:id/fire API（停心跳→归档→更新名单）
- 新增 CLI: lemon company fire / lemon company templates

Phase 4 人机流转机制打通:

1. 新增 API 与 CLI:
   - POST /api/agent/human-request 支持 Agent 求助
   - `node bin/lemon.js human request` CLI 暴露给 Agent 使用
   - 请求将自动追加至根目录 .env 文件并带有时间戳注释
   - 同时将记录追加至 Master 的 workspace/human_todo.md 待办清单
   - 触发实时通知事件给 Master Agent

2. `agent_creator` 人事专员模板创建:
   - 专门负责使用 `skill_search` (或自述构建) 并在新员工的 .claude/skills/ 下写武器代码
   - 强制为技能预留 .env 读取代码，并当 key 不存在时使用 human request
   - 强制在装配初版后将该技能推入 innovator-001 队列进行强化学习训练

3. 架构优化:
   - 修改 CTO Agent 模板指令：在 hire 底层员工的同时，强制 hire 一名 agent_creator
   - CTO 不再亲自绑定技能，全部通过 `task dispatch` 给 agent_creator 完成装配

- Add Company Overview tab as default landing page
- Show company info: status, uptime, agent count, heartbeat status
- Start/Stop company buttons (activate/deactivate all agent heartbeats)
- Per-agent heartbeat controls: interval dropdown, start/stop buttons
- Backend APIs: GET status, POST start/shutdown, PUT/POST agent heartbeat
- Track startedAt timestamp for uptime calculation
- Update CEO agent.md with mandatory 5-step startup workflow
- Fix company nav to default to overview tab

解决 CTO 无法自动把 CEO 设计图转化为系统流水线的问题:
- bin/lemon.js: 新增 pipeline create / pipeline list 命令行接口
- templates/cto/agent.md: 重写 4 步强制工作流, 明确用 json 注册流水线及循环 hire 工具
- templates/cto/tools.md: 新增 pipeline 注册命令与环境初始化命令
- templates/cto/soul.md & identity.md: 泛化架构师角色设定, 移除写死的旧业务名

Phase 2 改进:

1. 工作日历系统 (ScheduleService):
   - 新增 schedule-service.js: 公司级日程管理
   - 支持按小时调度、按周几过滤、时区感知
   - 心跳触发时自动检查到期 slots 并触发 Agent
   - 执行去重（同日同 slot 不重复触发）
   - CRUD API: GET/POST/PUT/DELETE /api/company/:id/schedule/slots
   - CLI: schedule add / schedule list

2. 告警通道 (Alert Channel):
   - Pipeline 步骤超时自动告警 Master Agent
   - 心跳异常自动告警 Master Agent
   - _sendAlertToMaster() 统一告警接口

3. CEO → Pipeline 自动生成:
   - CEO 模板从 3 步升级为 5 步工作流
   - 新增 Step 2: Pipeline JSON 设计（含 loop/cron/steps 结构)
   - 新增 Step 4: OKR 创建
   - Pipeline 设计输出为 CTO 搭建流水线的蓝图

4. Master 晨会日报:
   - 每天 08:00 自动生成全公司运营日报
   - 包含公司状态、Pipeline 运行、OKR 进度、Agent 活跃度
   - 自动推送给 Master Agent
   - 防重复机制（每天只生成一次）

5. Pipeline 驳回信息注入:
   - 驳回步骤被心跳重新触发时，__rejection 信息注入 prompt
   - 让 Agent 知道被驳回的原因和重做次数
   - 替换原有 curl 汇报指令为 task report CLI

Phase 1 核心改进:

1. Pipeline↔Task 系统打通:
   - task/report 回调自动推进 Pipeline 步骤
   - findActiveRunStep() 按 agentId 定位活跃步骤
   - 扫描所有公司的 Pipeline Runs 实现跨公司桥接

2. Pipeline 循环执行:
   - 新增 pipeline.loop 配置项
   - Run 完成后自动启动下一轮 (最大 maxLoops=365)
   - loopCount 计数器追踪循环轮次

3. COO 质量门控:
   - 新增 rejectStep() 驳回方法，含驳回历史记录
   - POST /api/agent/task/reject API 端点
   - POST /api/company/:id/pipelines/runs/:runId/reject 路由
   - node bin/lemon.js task reject CLI 命令
   - 驳回后自动唤醒 Agent 重做，注入改进意见

4. COO 模板全面强化:
   - agent.md: 4维度评分体系、质量审核流程图
   - soul.md: 性格、价值观、决策原则
   - tools.md: 新增 task reject 核心工具
   - heartbeat.md: 结构化巡检清单 + 升级规则

1. Rewrote master/agent.md: strict anti-overreach rules, cleaned git merge conflicts
2. Enhanced agent-creator/agent.md: force Write tool for new files, mandatory task report
3. Implemented task/report callback: auto-wakes sender agent to continue next steps
   - Added .tasks/ metadata persistence for dispatch→report traceability
   - task/report sends [TASK_CALLBACK] to dispatching agent on done/failed

- company.js: call heartbeatService._setupAgentHeartbeat after hire
- CEO agent.md: enforce 3-step continuous execution in same turn
- All CXO heartbeat intervals: 5 minutes
- task dispatch message: self-drive directive, use lemon CLI
- bin/lemon.js: add 'task report' command

…ter Agent cognitive auto-recovery loop

- Refactored CompanyDashboard into read-only Observer UI
- Enforced strict companyId:roleId namespacing across Node APIs and AgentManager
- Added dynamic <env_status> injection to PromptBuilder for robust context
- Introduced bin/lemon.js CLI for structured LLM tool execution
- Implemented in-stream error interceptors for implicit silent retry loop

…nti-confirmation prompts, cron dedup fix