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前一提交（c03ae10b）的 git add 因命令里混了一个已失效的 pathspec 而整体失败， 只有此前单独 git mv 出去的改名部分被记录下来，实际的引用修正全部漏提交。 补上：docs/README.md 索引（todo 表挪到 done 表 + 顶部状态行）、其余 27 系列 文档里指向该文档的相对链接（todo/ 与 done/ 下深度不同，分别处理）、 system/agents/*/agent.md 与 tools.md 里 cwd 深度 3 的 ../../../../../ 相对引用 （agent-md-refs.test.js 会校验这些链接真实可解析到文件）、_registry.json 的 description 字段、work-graph-templates/README.md、server/ 源码里的设计文档路径注释。 Co-Authored-By: Claude Sonnet 5 <noreply@anthropic.com> Claude-Session: https://claude.ai/code/session_01JnCKUFSGvdz4SY7BvYWdMU
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按 docs/README.md 既有约定（done/ 放「已实现/当前有效」），把两份已落地的 阶段设计文档移入 done/system-design/： - 27-p1-virtual-reference.md P1 虚拟引用寻址，commit 226489d - 27-p2-org-graph.md P2 Org Graph，70a4727 + f20d0d8，真实建公司端到端验证过 用 git mv 保留历史（R098 / R087）。移动断掉的 33 处相对链接已全部修复： moved 文件内的出向链接改 ../../todo/system-design/，todo/ 下 6 个文件的入向链接 改 ../../done/system-design/。全 docs/ 扫描无断链。 README 此前严重过时——只列了 2 份 27 文档，实际已有 11 份。本次补全 todo/ 表格， 每份标注状态与作用（总纲 / 需求源头 / 命名规范 / 端到端 / 参考场景 / P3+P4 已实现 / 验收契约 / P4 设计中），并在 done/ 表格补上 P1、P2 两行。 ■ 刻意没有移动 27-p3-p4-work-graph-console.md 它虽然已实现（c3abf4a），但文档正被另一进程持续修改（工作区 M 状态）。 移动会打断它的编辑路径，等它收尾后再归档。 ■ 三份文件的链接修复留在工作区未提交 27-naming-conventions.md / 27-p3-p4-work-graph-console.md / 27-requirement.md 里，我的链接修复与另一进程的在途编辑混在同一文件中，单独拆分风险大于收益。 工作区内容是正确的（链接已指向新路径），会随它下次提交一并带上。 Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>