宜博 / lemonboss

设计见 docs/done/system-design/28-agent-registry-unification.md。

改造前 Agent 本体散在三处（system/agents/ 11 个、system/templates/ 50 个、
data/companies/{id}/agents/ 17 个），同一个 AgentScaffold 被三个 baseDir 实例化。
后果是同一角色在 N 家公司下有 N 份互不相干的副本，模板更新不会同步；
org-coder / org-planner 这类走 hireFromBaseMetaAgent 造出来的本体
legacy_path 指回自己公司目录，永远无法被第二家公司复用。

本次：
- G1 单一注册表：system/templates/ 整体并入 system/agents/，base → _base。
  7 个同名 id 逐个裁决，被丢弃的一份归档到 docs/_archive/ 而非删除。
  source_kind(template/global_agent/company_hired) → origin(builtin/created)。
- G2 运行态下沉：CLI 的 cwd 从本体根改为 system/agents/{aid}/{cid}/{taskId}/。
  memory / conversations 落公司态 {aid}/{cid}/，按公司隔离不串。
  sessionPool 的 key 含 (companyId, taskId)，两家公司调同一 agent 不复用会话。
- G2b 产物不下沉：交付物仍落 data/companies/{cid}/，system/agents/ 只留运行痕迹。
  写入边界按链路分叉——graph 节点走节点私有目录（被 indexNodeOutputs 索引），
  chat 走公司 workspace，同一提示词里不再出现两条互斥指令。
- G3 公司只存引用：data/companies/{id}/agents/ 删除，新增 company_agents 关联表。
  不复用 org_graph_nodes——后者是执行流图，work 层本体被雇时不写它，天生覆盖不全。
- G4 缺则创建：本体缺失时从 _base 复制骨架进 system/agents/{id}/，
  agent-creator 填 agent.md/soul.md 后才从 draft 转 active（哨兵判据，
  骨架未填时哨兵仍在，不许被 hire）。产物即刻是全系统可复用的本体。

新增 server/services/agent-locator.js 收编原先散在 6 处的寻址逻辑。

边界守卫（graph-engine）的豁免从「本体根上五个文件名」放宽为整棵 system/agents/：
新本体的骨架本来就要进 git，gitignore 挡不住 ?? system/agents/{newId}/，
旧判据会把一个真正成功的招聘节点判成 boundary_escape fail。

存量迁移见 scripts/migrate-agent-registry.js（幂等，备份到 data/_migration-backup-*）。

真 Claude CLI E2E 已验证：新建公司 → orggraph-planning 自动规划 →
自动招聘 org-planner/org-coder/org-validator 三节点流水线；
data/companies/{cid}/agents/ 不存在，company_agents 4 行，
system_agents 56→56（零新建私有本体，纯复用），git status 零增量。

Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>

## 起因

integration 测试里 `process.env.API_KEYS = 'test-api-key-123'` 是死代码：
生产读的是 OPEN_API_KEYS（config.js:31），而这个测试文件里 API_KEYS 只出现
这一次赋值，没有任何 /api/open/* 请求、没有任何 key 相关断言。已删。

（更正上一轮的判断：它不是「为了错误的原因而绿」——它什么都没测，
所以也谈不上错。两个缺陷互相抵消成了无害。）

## 为什么错名字能活这么久

api-key-auth.test.js 原有 7 条用例**全在测 extractApiKey**（怎么从 header/query
取出字符串），而做鉴权决定的 requireApiKey 一条都没有。OPEN_API_KEYS 那条分支
从来没被执行过 —— 没有测试执行过的路径，喂给它什么名字都不会有人知道。

补 4 条（拦/放两侧各两条）：无 key → 401「需要 key」/ key 无效 → 401「key 不对」/
命中系统 key 列表 → 放行且挂 req.apiKey / 命中用户 api_key → 放行且挂 req.user。

## 补完当场抓到一个真缺陷（这一条才是重点）

requireApiKey 把 findByApiKey 返回的**原始数据库行**挂上 req.user，带着
password_hash。JWT 那条路（jwt-auth.extractUser）一直是过 toPublicUser 才挂的 ——
两条鉴权路径行为不一致，而 req.user 是 handler 唯一的身份来源。

当前没有实际泄漏（open-api 的 handler 只读 req.user?.id / ?.email，
没有哪个把整个对象回给调用方），但将来任何一个 res.json({ user: req.user })
都会把 bcrypt 哈希发给外部 API 调用方。改成过 toPublicUser。

顺带确认 requireApiKey 本身是 fail-closed 的：无 key 401；key 既不匹配用户
api_key 也不在配置列表 401。OPEN_API_KEYS 为空只是让系统级 key 全部失效，
不放开任何东西 —— 所以那个错名字不构成安全漏洞。

## 验证

862 全绿（85 文件）。4 处变异逐一精确变红后逐字还原。

其中 T3 值得记：第一版「无 key → 401」只断言状态码，而把 if (!key) 改成
if (false) 之后测试仍全绿 —— 因为纵深防御，key=null 会落到第二道门照样 401。
两者的区别在**文案**（「需要 key」vs「key 不对」），而我在另一条用例的注释里
自己写了「两种失败要分得开」却没断言它。补上文案断言后 T3 才真的变红。
只断言状态码的鉴权测试基本都有这个盲区。

数据核查：跑完全套后共享 users.sqlite 的 sha256 不变、用户数仍为 1
（新用例用 USERS_DB_PATH 打到 /tmp —— 这个覆盖口是上一轮刚补的，
在它存在之前这组用例会往共享生产库里插测试用户）。

Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>

起因是一个看起来无害的问题：<repo>/data/users.sqlite 为什么是 0 字节。
答案是没人用它——user-db 走三级上跳落在仓库外的 ~lemonAI/data（跨兄弟仓库
共享的平台数据，与 skill-db / benchmark-db 一致；仓库内 data/ 放 graph/companies/
devloop 这类租户数据）。那个空文件是遗留，已删。

顺着查下去发现三处同型缺陷，形态都是「产生 → 传递 → 落库 → 读回」漏掉读回，
而且是最有欺骗性的一种：测试设了隔离用的 env，没有人读，于是数据全写进
**共享的生产库**，测试照样全绿，afterAll 删的 /tmp 文件从来没被创建过、清理还“成功”。

1) USERS_DB_PATH 压根不存在
   user-db.test.js 只能直写共享用户库（注释老实写着 "uses hardcoded
   data/users.sqlite"），afterAll 是空的、拿「邮箱按 UUID 唯一所以不会撞」
   当成了不用清理的理由。不撞是真的，不堆积是假的：357 个用户里 356 个是夹具。
   加 USERS_DB_PATH 覆盖口（口径同 graph-db 的 GRAPH_DB_PATH），测试改为
   先设 env 再清 require.cache 再 require（DB_PATH 是加载时求值的常量，
   顺序错了照样静默失效），afterAll 真删库文件。

2) BENCHMARK_DB_PATH 有人设、没人读
   benchmark-db.test.js:13 与 integration/api-routes.test.js:43 都在设它，
   而 benchmark-db.js 那一行不读 → 共享 benchmark 库攒了 342 行
   skill_name=benchmark_test。补上读取后，两个测试文件一行不改就真隔离了
   （日志里 Initialized SQLite at /tmp/... 第一次是真的）。

3) SKILLS_DIR 是写错的变量名
   config.js:13 读的是 SKILLS_CODE_DIR，所以 skillsCodeDir 一直指向那个
   2.7 万条的真实共享 skills 目录。两个测试文件的变量名改正。

新增 guard server/tests/unit/test-isolation-env.test.js：
测试赋值过的**路径类** env（_DIR/_PATH/_ROOT 结尾）必须有生产读者。
只管路径类是刻意的——那是会造成静默数据污染的地方，而 HOME（os.homedir 间接读）、
JWT_SECRET、PORT 这类天然不在范围内，不需要维护会腐烂的白名单。
顺带钉住「共享 data 在仓库外」这个有意的分层，免得被“修”回仓库内。
guard 第一版把自己文档注释里的举例当成真赋值、自己判红了，所以两侧都先剥注释——
凡是静态扫源码的检查都要先想清楚该量的是代码还是文本。

数据清理：共享 ~lemonAI/data/users.sqlite 删掉 358 行夹具
（不是 356——修好之前又跑了两轮测试，每轮 +2，正好印证泄漏一直活跃），
删前备份 + 计数闭合校验（保留行 + 匹配行 == 总数才动手），
删后真人 bboonnee@gmail.com 完好，总数 1。

验证：854 全绿（84 文件）。跑完全套后 users / benchmark_logs / skills
三个共享库的 sha256 逐位不变——修好之前这不可能。
3 处变异逐一精确变红（去掉任一 env 读取、把变量名改回错的）后逐字还原。

未动：JWT_SECRET / API_KEYS 生产侧无读者或名字不符（config.js 读 OPEN_API_KEYS），
不造成数据污染，另报；共享 benchmark 库那 342 行夹具未清，等确认。

Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>

用 9 个并行 agent 按「文件独占」划分实现 P2 的 T1-T9（T0 已于 2255f09 完成）。
详见 docs/todo/system-design/27-p2-org-graph.md §五。

阶段 A · 数据层
- graph-db.js: org_graph_nodes 加 status/reports_to_node_id（PRAGMA 探测后 ALTER，
  幂等）；全量唯一索引换成 WHERE status='active' 的部分索引，使「fire 后重新 hire
  同角色」可行；org_graph_edges 重建为执行流边（condition/edge_kind/status）
- graph-service.js: ensureOrgGraphNodeIndex 同步改建部分索引，且 upsertOrgGraphNode
  的 ON CONFLICT 必须写成 ON CONFLICT(company_id, role_name) WHERE status='active'
  —— SQLite 的冲突目标要与部分索引谓词逐字对应，否则整条 INSERT 直接失效
- org-graph-service.js（新）: validateGraph 四项校验 + writeGraph/patchGraph/
  getGraph/removeNode，事务化，节点软删除级联失效相关边
- routes/company.js: 四个端点 POST/PATCH/GET /org-graph + POST /org-graph/replan；
  /create 接入自动招聘 orggraph-planning + 异步触发（失败降级为空壳公司）；
  /fire 接入节点软删除

阶段 B · 自动生成
- system/org-graph-templates/{dev,content,ops}.json + README：三张三段式骨架
  （规划→执行→验收，验收失败回退到执行节点），角色名遵循 {domain}-{职能}
- system/templates/orggraph-planning/：新 system agent（type='meta-bootstrap'），
  含 §4.1 八步工作流
- company-service.js: 模板不存在时从 system/templates/base/ 元 agent 继承骨架
  （自动带 RESEARCH→PLAN→EXECUTE→VERIFY 四段式）+ agent-creator 填充，
  新建 agent scope='company'。这是 27-E2E §八bis 元 agent 继承的落地点

阶段 C · 展示
- CompanyDashboard.vue: 组织流程拓扑链渲染 + 空态降级 + 环深度保护

并行编排中发现并修复的三处（均不在原任务划分内）：
- AppNav.vue 建公司表单缺 goal 输入框 —— T0 只改了后端，前端表单没同步，
  company-goal 实际传不进来。这是上一轮 T0 的遗漏
- graph-seed-service.js 会把 type='meta-bootstrap' 的 orggraph-planning 塞回
  org graph，与 hire() 的 guard 不一致
- graph-agent-p1-acceptance.test.js: hire 未知角色的返回从 needs_training 改为
  hired_from_base（T5b 的行为变更），断言同步

验证（独立复核，非 agent 自述）：
- npm run test:unit 676 passed / 63 files（基线 652，+24 为新增的 org-graph 用例）
- npm run web:build 通过
- 三个模板 JSON 实跑 validateGraph 全部通过；四类非法图各自被对应 rule 拒绝；
  writeGraph→getGraph→removeNode 级联验证通过（删中间节点后 3 条边全部失效）

Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>

hire() now checks system_agents (source_kind='template') before provisioning a new
company agent: if the role has a shared template row, skip copying agent.md and
instead let AgentManager.getAgentConfig()/PromptBuilder.build() resolve the prompt
from the shared legacy_path at call time, with per-company context assembled from a
new company-context.md. Roles without a template row (including the 6 ids that exist
in both system/agents/ and system/templates/, e.g. evolver-youtube-crawler) fall back
to the existing full-copy behavior unchanged.

- server/services/graph-service.js (new): lookupSharedAgentMd(), upsertOrgGraphNode()
- server/services/company-service.js: hire() reference-mode branch, _provisionReferenceAgent()
- server/src/core/agent-manager.js: getAgentConfig() resolves prompt/companyContextPath
- server/src/core/prompt-builder.js: build() concatenates company-context.md
- unit + integration tests covering all 6 acceptance criteria from
  docs/todo/system-design/27-p1-virtual-reference.md §6, including a regression test
  against the real idearun:evolver-youtube-crawler naming-collision case

Full regression suite (587 tests) passes; independent adversarial review found 0
blocking/major issues.

Co-Authored-By: Claude Sonnet 5 <noreply@anthropic.com>

- Agent as Micro-Container: each agent lives in data/agents/{id}/ with full encapsulation
- Persona vs Capability split: agent.md (identity) + .claude/skills/main_skill/SKILL.md (workflow)
- Conversations co-located: data/agents/{id}/conversations/ replaces global dir
- Meta Skills renamed: meta_hunt, meta_digest, meta_creator, meta_evolving, meta_benchmark, meta_research
- Dynamic Hot-Reload: AgentManager.getAgentConfig() falls back to filesystem scan
- Parallel Sub-Agent orchestration via Promise.all with multi-terminal UI
- Removed SQLite dependency, global skills/ directory, and legacy conversations/
- Full architecture docs: 18-local-filesystem-first-agent-encapsulation.md