宜博 / lemonboss

改名：task-benchmark / task-test-data / task-test-script
   → goal-benchmark / goal-test-data / goal-test-script

理由（推翻此前"验收标准跟着一次 task 执行走"的论证）：关键区分是基数。
一个人类需求描述 = 1 个 goal，是验收的边界；而 goal 在图中会分解出 N 个 task
（并行分支、下钻的 sub agent）。验收回答的是"人类想要的东西做到了没有"，
这是 goal 级判定；挂在 task 上会导致"以哪个 task 的验收为准"无法回答。

NAMING §一 作用域表补入 goal / task 两行及其基数定义；§四 重写选型理由；
§六 增加与 §四 的辨析注（OKR 从 goal 解放后，goal 被重新赋予"人类需求"新义）。

连带：
- acceptance.json 的键改为 goal_id
- work_graphs schema 补 goal_id，与 okr_node_id / task_id 并列（三者基数不同，
  分别是 1 / 长周期归属 / N，不能用单一字段表达）
- 新增 27-REQ R-12 记录本次决策及其推翻关系

修复上一轮的一处失误：全局改名误改了 27-REQ 中的原话引用（R-10 一度被改成
"goal-benchmark 或者 goal-benchmark"）。原文照搬文档不得被批量替换触及，已还原。

Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>

此前 27 系列全部是对用户需求的转述与结构化解读，原话一句都没留存
（搜 "judge-loop-jump"、"元 agent 架构来继承生成" 等关键短语均 0 命中）。
转述会漂移，出现"当初到底怎么说的"争议时缺少可回溯的依据。

格式与定位对齐仓库既有惯例 docs/prd/newfunction/_spec/requirement.md
（DevLoop 的原始需求页："用户提出的需求原话照搬，再做结构化解析"）。

内容：11 条需求原话逐条照搬（R-1..R-11），含笔误一律保留
（validtor / syste agent / intergration / fin in / object-key result），
每条标注落在哪份文档的哪一节，附"需求 → 设计落点"速查表。

同时记录三处关键推翻关系，便于回溯设计演变：
- R-7 推翻了"benchmark/test data 是系统基础设施"的误读
- R-9.1 推翻了 P2 v0.1-v0.3 的静态汇报结构建模及 A/B/C 三个折中方案
- R-9.4 使跨公司污染风险及其三个缓解方案全部作废

另澄清 27-EXAMPLE 的「配图工厂」是为走查虚构的场景，非用户原始需求。

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新增四份文档：

- 27-e2e-task-execution-flow.md — 跨阶段总览：建公司 → 下达任务 → org graph
  逐节点执行 → work graph 规划与循环 → 验收收敛。核心发现：这套流程 70-80%
  已在 docs/prd/newfunction/_spec/ 里被完整设计（DevLoop 的 L1/L2/L3 三层循环、
  BugTriager 四分类归因、分级预算熔断、contract_hash 闸门），DevLoop 实为本
  架构唯一跑通的参考实现，通用引擎应从它抽象而来。
- 27-example-dev-company-walkthrough.md — 参考场景走查，把架构在一家具体公司
  上跑一遍数（各阶段 JSON 形态、fan-out/fan-in 图、成本估算 ~44 次调用、
  按阻塞程度排序的 8 个断点清单），作为实现靶子与端到端验收场景。
- 27-naming-conventions.md — 统一命名规范 {作用域}-{职能}。消歧三种 benchmark
  （skill- / agent- / task-）；OKR 体系正名（goal → okr，第 1 层 Goal → Objective）；
  规划类统一为 orggraph-planning / workgraph-planning / brd-prd-sdd-planning。
- 27-p3-p4-work-graph-console.md — P3/P4 合并设计：Work Graph 执行引擎（支持
  启动/下一步/暂停/停止/重试，手动与自动共用同一 advance 原语）+ 执行控制台页面。

重写 27-p2-org-graph.md 至 v0.4：Org Graph 从「静态汇报结构」重定位为
「company 级别生成的 workflow」，与 Work Graph 同构（condition/edge_kind 执行流边），
两层共用同一套 schema、执行引擎与画布组件。org_graph_edges 从未写入过数据，
可直接 DROP 重建，零迁移负担；hire() 不再需要 reportsTo（图整体规划整体写入），
P2 对 company-service.js 的侵入缩至零。

同步修正总纲至 v0.3：Org Graph/Work Graph 术语定义、§3.1 架构图、§3.3 整节；
标注 P1 已实现（226489d）；P6「DevLoop 收编」从「可选」改为「应前置」。

修正三处过期陈述：P1 已实现（非设计稿）、runProject 已完整实现（非 501）、
UnitsDAG.vue 已实现 Kahn 分波 DAG 渲染（画布应扩展而非重写）。
并记录一处待处理冲突：graph-service.js:44 已落地的全量唯一索引与 P2 需要的
部分唯一索引冲突，实现 T1 时必须先 DROP。

Co-Authored-By: Claude Opus 5 (1M context) <noreply@anthropic.com>

- New docs/README.md indexes the tree: done/ (shipped features + reference manuals),
  todo/ (current focus — Graph Agent architecture), todo/future/ (deprioritized
  roadmaps: FDE pipeline todo list, stale v1.1 milestones, harness engineering
  proposal — orthogonal to the Graph Agent work, not blocking it)
- Move completed/reference docs into docs/done/ (LEMONBOSS-SYSTEM-DESIGN, architecture-v5,
  claude-code-cron, open-api-manual, qa_judge_req, task_timeline_design, user-guides/,
  system-design/01-26 minus the three moved to todo/future/) — verified against actual
  code (qa-judge template, Task Timeline route/service/view) before filing as done
- Fix the two TOC links in LEMONBOSS-SYSTEM-DESIGN.md that would otherwise point at the
  old paths after the move
- docs/todo/system-design/27-graph-agent-architecture.md: add the P2 Org Graph doc link
  in the roadmap table and 关联文档 section
- Add docs/todo/system-design/27-p2-org-graph.md (P2 requirements & design, drafted in
  parallel while P0/P1 landed)

Co-Authored-By: Claude Sonnet 5 <noreply@anthropic.com>

hire() now checks system_agents (source_kind='template') before provisioning a new
company agent: if the role has a shared template row, skip copying agent.md and
instead let AgentManager.getAgentConfig()/PromptBuilder.build() resolve the prompt
from the shared legacy_path at call time, with per-company context assembled from a
new company-context.md. Roles without a template row (including the 6 ids that exist
in both system/agents/ and system/templates/, e.g. evolver-youtube-crawler) fall back
to the existing full-copy behavior unchanged.

- server/services/graph-service.js (new): lookupSharedAgentMd(), upsertOrgGraphNode()
- server/services/company-service.js: hire() reference-mode branch, _provisionReferenceAgent()
- server/src/core/agent-manager.js: getAgentConfig() resolves prompt/companyContextPath
- server/src/core/prompt-builder.js: build() concatenates company-context.md
- unit + integration tests covering all 6 acceptance criteria from
  docs/todo/system-design/27-p1-virtual-reference.md §6, including a regression test
  against the real idearun:evolver-youtube-crawler naming-collision case

Full regression suite (587 tests) passes; independent adversarial review found 0
blocking/major issues.

Co-Authored-By: Claude Sonnet 5 <noreply@anthropic.com>

Adds server/services/graph-db.js (new data/graph.sqlite: system_agents,
org_graph_nodes, org_graph_edges) and graph-seed-service.js, which scans
system/agents/, system/templates/, and data/companies/*/company.json into
seed rows without touching company-service.js's existing hire/copy path.

Real repo data diverged from the design doc's original estimates (8 not 10
global agents; 39 not 34 template dirs; system/agents/ and system/templates/
turn out to share 6 ids describing the "same" agent from two different
files) — documented in docs/todo/system-design/27-graph-agent-architecture.md
section 7 for P1/P2 to resolve.

Co-Authored-By: Claude Sonnet 5 <noreply@anthropic.com>